刘承元的自主创新经营(又称全面改善)管理理论是他针对国内企业管理界现存的六大积弊，在引进日本的优秀管理方法并使之与中国的国情文化相结合的基础上，精心独到地架构起来的，在业界已经颇具影响。
自主创新经营论原又称全面改善管理论，全面即全员和全流程的意思。图中黄框部分所示是企业既有的职能任务模块，负责向客户提供产品或服务;而蓝框部分是现有绝大部分企业尚欠缺的部分，是负责推动任务模块提升的管理创新模块。如果没有了蓝框部分的支持，黄框部分是永远不可能自主提高的。就好像没有支点或抓手，人不能拔着自己的头发离开地球一样!
图示中的自主创新经营的理论架构看似一幢结构稳定的房屋，房屋的各个部分形象地表述了各个模块在企业经营中的作用。任务模块由纵向存在的复数根柱子组成，是房屋的主体，有了它企业就可以开展经营活动了(如何设计职能任务模块中的职能系统因不是其讨论的重点，此处未一一具列)。
图中房屋的底部的 1、2、3层是企业管理的三个基础：
1)即便是正常运营的企业，管理者也经常会抱怨企业管理基础太差，但具体差在哪里又说不清楚。而在刘承元看来，管理基础差就体现在员工缺乏问题意识，工作随意没有养成按标准做事的良好习惯。企业可以通过持续开展源自于日本的5S(整理、整顿、清扫、清洁、素养)等管理活动来不断革新员工意识，培养员工良好习惯。
2)管理基础差还体现在员工不爱学习甚至抵触企业各项培训活动，技能和(解决问题)能力提升慢。企业可以通过导入技能奖励政策和规划员工成长晋级通道等措施来建设学习软硬环境，引导员工自主学习。
3)管理基础差又体现于员工缺乏主人翁精神，企业管理活动没有员工广泛参与。企业可以通过规划各种不同形式的展示舞台，让员工有机会把工作中的精彩和智慧充分展示出来，挖掘员工智慧，生发员工力量。
在刘承元的自主创新经营理论中，这三大管理基础是优秀企业文化的重要组成部分，是企业高层影响人和凝聚人的重要工作。
图中房屋的中部的 4、5、6三条横梁是企业进行“绩效改善”的三个机制：
4)此为活动机制之一，指的是自主管理活动，它是基层员工以班组为单位开展的持续上台阶改善活动。每一个台阶都要定义明确地改善目标和具体地改善内容。持续运营这项活动，可以让远离领导的基层能够及时消除缺陷，纠正错误和提升意识、技能和能力。
5)此为活动机制之二，指的是员工提案活动，企业以制度化的奖励措施引导所有员工个体主动发现自己身边的问题，动脑筋想办法解决这些问题，并最终把解决问题的过程和结果用指定的表格总结出来提交给领导。通过开展这项活动可以培养有积极性的员工。所谓员工积极性就是员工主动付出智慧的意愿和行动。
6)此为活动机制之三，指的是课题改善活动，部门或跨部门的中层精英组织起来，旨在解决企业焦点问题的小集团活动。这项改善活动的课题通常来源于企业的经营战略，主要涉及效率、质量、成本、交货和安全等多个方面。课题改善做得好，可以极大地支撑企业经营战略的实现，提升企业竞争力水平。在课题改善过程中，员工需要学习和掌握诸如IE(工业工程)、TPM(全员生产性保全)、QC工具、6Sigma、JIT等许多改善工具和方法，企业可以进行针对性的培训。
7)图中房屋的顶部是企业高层进行“绩效经营”(理念+算盘)的机制和方法。
国内企业也有所谓的目标管理活动，通常的做法是：年初定目标，由部门负责人或员工签订目标责任书;年底对照目标进行绩效考核，期望以此提升管理水平。结果可想而知，那种提升管理水平的目标只不过是企业高层的一厢情愿。
而绩效经营的做法主要分为两个部分：一个是理念、目标和战略的落地;另一个是培养团队学会部门或团队效益核算，并从核算表中发现问题和改善的方向。
首先，高层(团队)负责制定企业经营方针(理念、愿景、价值观等)，提出经营目标，研讨经营战略;把每一个经营战略分解为若干个重点课题，制定《年度或半年度经营计划》;指导部门管理者把课题分解为措施，制定可操作的《部门实施计划》;每月一次面对面跟进和辅导各部门管理者扎实落实《部门实施计划》。绩效经营活动不仅可以统一和加强团队意志，更重要的是通过对部门管理进行月度实时跟进辅导，保障措施的落实和目标的达成。
其次，企业内要建立健全效益核算体系，具体定义出“利润中心”和“费用中心”及其效益核算规则。通过算盘管理，培养管理者和员工强烈的绩效经营(开源+节流)意识，帮助管理者和员工从效益核算表中发现问题，规划改善课题，落实改善措施，让企业经营效益成为可规划和可管控的事物。
综上7个层次，与企业既有的职能任务模块交融生发，形成一个全方位的持续的自主改善提升的立体管理体系。只要按照该论所倡导的理念和方法去持续展开经营管理创新活动，企业就不仅可以提升其硬实力，而且——也是更重要的——可以获得生生不息的软实力。自主创新经营管理理论已经在许多本土企业的成功实践中得到验证。
当然，有人担心这个管理理论只适用于制造型企业，其实制造型企业的管理是最精细和最科学的管理，值得任何行业和企业借鉴和学习。王石的万科就是借鉴了制造业管理的思想和方法，才成就了国内最精益的房地产企业。
出乎其外而观之，这个模式既吸取了日本及西方式的精细和条分缕析，也能从中看到中华本土文化之特色，它重一统，重内省，重自我提升，尤其重东方式的以人为本，充分关注员工意识和能力的渐进提升。所以说这个模式在中国企业管理界中受到欢迎，也在情理之中了。
